مطالعه بیوانفورماتیکی ژن wdhn۱۳ در گونه های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید گندم با استفاده از روش insilco aflp analysis
نویسندگان
چکیده
سابقه و هدف: ژن wdhn13 کد کننده پروتئین های گروه 2 lea می باشد. پروتئین های lea اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. ساختار اولیه پروتئین های lea شامل دمین های اولیه باردار و بدون بار از آمینواسید های قطبی باقی مانده اما غیرآبدوست می باشد، که دلالت برآبدوست بودن پروتئین های lea دارد. مواد و روشها: در این تحقیق روابط فیلوژنتیکی و بیوانفورماتیکی ژن wdhn13 در 8 گونه گندم مطالعه شد و جهت آنالیز های مولکولی 3 آنزیم برشی: hindiii با سایت برشی aagctt، alubi با سایت برشی agct و taqi با سایت برشی tcga استفاده شد و توسط نرم افزار بیولوژیکی clc به صورت insilco و در شرایط خارج آزمایشگاهی به توالی ها اعمال شد. یافته ها: نتایج حاصل از آنالیزهای فیلوژنتیکی بر اساس الگوریتم upgma نشان دهنده این موضوع بود که گندم های مورد بررسی از لحاظ این ژن در3 گروه قرار دارند.که گروه اول شامل 4 رقم گندم نان(توالی موجود در ncbi)، گندم سرداری، گندم دوروم شوش و گندم دوروم بروجرد، گروه دوم شامل 1رقم وحشی اورارتو و گروه سوم شامل 2 رقم نان گنبد و دیکوکوئیدز بودند. نتیجه گیری: نتایج این تحقیق نمایانگر ارتباط ویژه و نزدیکی بعضی گونه های مورد مطالعه بود.
منابع مشابه
مطالعه بیوانفورماتیکی ژن Wdhn13 در گونه‌های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید گندم با استفاده از روش Insilco AFLP Analysis
سابقه و هدف: ژن Wdhn13 کد کننده پروتئین های گروه 2 LEA می باشد. پروتئین های LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. ساختار اولیه پروتئین های LEA شامل دمین های اولیه باردار و بدون بار از آمینواسید های قطبی باقی مانده اما غیرآبدوست می باشد، که دلالت برآبدوست بودن پروتئین‌های LEA دارد. مواد و روشها: در این تحقیق روابط فیلوژنتیکی و بیوانفورما...
متن کاملبررسی الگوی بیان ژن رمزکننده ی آنزیم nadp- mali در آجیلوپس و برخی گونه¬های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید گندم
در این پژوهش برای بررسی بیان ژن رمز کننده tanadp-me1 در گندم نان و خویشاوندان آن از 4 گونه شامل: aegilops crassa، triticum boeticum، triticum turgidum و triticum aestivum استفاده شد. بذر گیاهان مذکور در تابستان سال 1392 در قالب طرح کاملا تصادفی با سه تکرار در گلدان¬های دوکیلو گرمی در گلخانه تحقیقاتی دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز کشت شدند. یک جفت آغازگر اختصاصی بر اساس توالی ژن tanadp-me1 و یک ج...
15 صفحه اولآنالیز بیوانفورماتیک کدونی ژنوم کلروپلاست گونه های دیپلوئید و مقایسه با ژنوم دو گونه تتراپلوئید پنبه
تجزیه کاربردی کدون اهمیت ویژه‌ای در بهینه‌سازی سامانه بیان ژن‌ها در تولید پروتئین دارد. جنس گوسیپیوم مهمترین گیاه تولیدکننده الیاف در دنیای جدید می‌باشد. در این تحقیق توالی کامل ژنوم کلروپلاست دو گونه G.thurberi و G.arboreum توسط نرم افزار کدونW مورد مطالعه و تجزیه قرار گرفت. تجزیه کدون‌های دارای ترادف (RSCU) برای 57 ژن کدکننده پروتئین در ژنوم کلروپلاست این دو گونه به منظور دستیابی به فاکتورها...
متن کاملاستفاده از خصوصیات ریخت شناسی سنبله در تاکسونومی گونه های تتراپلوئید و هگزاپلوئید جنس گندم در ایران
به علت شباهت فراوان ریخت شناسی میان گونهٔ تتراپلوئید تریتیکوم تورژیدوم2 و گونهٔ هگزاپلوئید تریتیکوم استیووم3، در این پژوهش سعی شده است تا با استفاده از 34 صفت کمی و 9 صفت کیفی ریخت شناسی سنبله موقعیت تاکسونومی و تغییرات صفات ریخت شناسی در بین 22 جمعیت از تریتیکوم تورژیدوم و 42 جمعیت از تریتیکوم استیووم بررسی شود. بدین منظور از معیارهای آماری نظیر میانگین و ضریب تغییرپذیری و از تحلیل خوشه ای و فاک...
متن کاملمطالعه مولکولی و آنالیز توالی ژن Wdhn13 (LEA) در گندم های زراعی نان، دوروم و گونه های دهنده ژنومی آنها
سابقه و هدف : پروتئین‌های LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین‌های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. بیشتر دسته بندی‌های عمومی ژن‌های LEA به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست می‌آید. روش‌های بیو انفورماتیکی روش‌های مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی می‌باشند. مواد و روشها : در این تحقیق جهت مطالعه ژن Wdhn13 پروتئین های LEA درگ...
متن کاملمطالعه انتقال پذیری مارکرهای میکروساتلایت گندم هگزاپلوئید (Triticum aestivum L.) به ژنوتیپ‌های مختلف گندمهای هگزاپلوئید و تتراپلوئید
گندم یکی از مهمترین محصولات غذایی است که درک ژنتیک و نظم ژنومی آن با استفاده از مارکرهای مولکولی از اهداف مهم برای اصلاح ژنتیکی این گیاه است. در این مطالعه انتقال پذیری 96 مارکر میکروساتلایت از گندم هگزاپلویید به 5 ژنوتیپ گندم، شامل رقم هگزاپلوئید زمستانه مقاوم به سرما میرونوسکا 808، رقم بهاره گندم هگزاپلوئید چای نیزاسپرینگ، گندم تتراپلوئید دوروم رقم لانگدون و دو زیر گونه از گندم تتراپلوئید(Tr...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
مجله تازه های بیوتکنولوژی سلولی - مولکولیجلد ۳، شماره ۱۱، صفحات ۱۵-۲۰
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023